Les bookmarks de Clem
2380 shaares
Oulah c'est du lourd. Discussion entre Ben Bolker, Bob Carpenter, Christian (Robert?), et Andrew Gelman sur l'utilisation des BIC pour identifier les clusters dans les modèles de mouvements utilisés par les écologues. Faut que je prenne le temps de lire le truc, mais ça à l'air très intéressant, à plus d'un titre.
Morceau choisi: "I think BIC is fundamentally different from AIC, WAIC, LOO, etc, in that all those other things are estimates of out-of-sample prediction error, while BIC is some weird thing that under certain ridiculous special cases corresponds to an approximation to the log marginal probability."
Il semble pas hyper convaincu par le BIC... c'est pourtant un critère que j'aime bien (plus que l'AIC quand l'objectif est explicatif). Faut que je prenne le temps de creuser ces arguments, je voudrais pas passer à côté d'un aspect important.
Morceau choisi: "I think BIC is fundamentally different from AIC, WAIC, LOO, etc, in that all those other things are estimates of out-of-sample prediction error, while BIC is some weird thing that under certain ridiculous special cases corresponds to an approximation to the log marginal probability."
Il semble pas hyper convaincu par le BIC... c'est pourtant un critère que j'aime bien (plus que l'AIC quand l'objectif est explicatif). Faut que je prenne le temps de creuser ces arguments, je voudrais pas passer à côté d'un aspect important.
Je suis assez d'accord avec l'analyse. Après, au niveau professionnel, il y a certains utilisateurs intéressants à suivre. Des qui sont super doués pour dénicher ZE papier passé inaperçu et super utile pour la résolution de telle ou telle problématique. Je passe pas ma vie sur twitter, je m'en sers comme d'un lecteur de flux. Je regarde, dans des listes, ce qu'ont twitté ces personnes. Et je m'en tiens éloigné dès qu'un évènement majeur se produit (récemment, élection de Trump, brexit, résultat de la primaire de la droite en France). Le bruit sur twitter à ce moment là noie toute l'info, et ya plus rien à en tirer.
...ou alors on compile le fichier .tex avec lualatex et tous les problèmes d'encodage sont gérés par le package fontspec.
J'avais oublié que j'étais passé à lualatex, et j'arrivais pas à retrouver les accents...
J'avais oublié que j'étais passé à lualatex, et j'arrivais pas à retrouver les accents...
Une explication claire aux différences entre fontenc et inputenc. Le premier définit les fontes utilisées en sortie, le second définit l'encodage utilisé en entrée, au moment de l'utilisateur du texte.
Du coup, à mettre dans l'en-tête d'un document latex:
\usepackage[T1]{fontenc}
\usepackage[utf8x]{inputenc}
Du coup, à mettre dans l'en-tête d'un document latex:
\usepackage[T1]{fontenc}
\usepackage[utf8x]{inputenc}
Mettre à jour shaarli
Dans la série "j'arrive pas à me motiver à écrire ce putain de papier qui me motive pas du tout du tout, ça fait longtemps que j'ai pas fait le tour de mes RSS que j'avais taggé 'à lire plus tard' la veille c'est important si on veut pas être dépassé, oui je sais je suis hypocrite, vite un peu de narcissisme", voici un site du même style que Depsy, connecté à l'orcid, et qui permet de mesurer l'impact d'un chercheur.
Plein de métrique pour mesurer la qualité d'un chercheur. Par contre, j'ai l'impression qu'on ne peut voir que son propre profil.
Plein de métrique pour mesurer la qualité d'un chercheur. Par contre, j'ai l'impression qu'on ne peut voir que son propre profil.
Un site qui permet d'évaluer l'impact d'un programmeur dans le domaine scientifique en fonction de trois critères:
* Nombre de citations dans des papiers open access (l'algo n'a pas accès aux papiers derrière un paywall)
* Réutilisation du code par d'autres (basé sur l'algo pagerank de google)
* Nombre de téléchargements
Le site est décrit dans un article de nature: http://www.nature.com/news/the-unsung-heroes-of-scientific-software-1.19100
Apparemment, l'auteur va chercher à ajouter une nouvelle métrique basée sur le nombre de discussions sur internet qui citent un package. Le site indique également que l'on pourra bientôt faire le lien avec l'orcid.
À suivre, donc!
* Nombre de citations dans des papiers open access (l'algo n'a pas accès aux papiers derrière un paywall)
* Réutilisation du code par d'autres (basé sur l'algo pagerank de google)
* Nombre de téléchargements
Le site est décrit dans un article de nature: http://www.nature.com/news/the-unsung-heroes-of-scientific-software-1.19100
Apparemment, l'auteur va chercher à ajouter une nouvelle métrique basée sur le nombre de discussions sur internet qui citent un package. Le site indique également que l'on pourra bientôt faire le lien avec l'orcid.
À suivre, donc!
Sinon, pour chercher dans R, ya ça.
Edit: j'avais pas vu les onglets au sommets des résultats de la recherche, c'est génial, on peut explorer les différents types de résultats, bouquins, articles, etc.
Edit: j'avais pas vu les onglets au sommets des résultats de la recherche, c'est génial, on peut explorer les différents types de résultats, bouquins, articles, etc.
Un site très intéressant que je ne connaissais pas, conçu pour chercher des fonctions dans les 11000 packages de CRAN. Super bien conçu, avec statistiques de téléchargement. On y apprend que adehabitatHR est mon package le plus téléchargé avec 450 téléchargements directs mensuels en moyenne, adehabitatMA le plus téléchargé indirectement (via le biais des dépendances vers d'autres packages) avec plus de 1000 téléchargements mensuels, et qu'il reste en moyenne 190 personnes qui continuent à télécharger chaque mois l'ancienne version d'adehabitat, et ce malgré toutes mes mises en garde sur le fait que j'arrêtais de le maintenir...
Le site contient aussi des historiques de téléchargement, des diagrammes de dépendances et de reverse dependances. Il est participatif, et il y a moyen de s'inscrire pour améliorer les aides.
Et moyen d'exécuter les exemples sans lancer R, directement sur le site. Pas mal.
Vu la difficulté qu'il y a souvent à chercher dans les fonctions de R, je pense que le gars qui a fait ça a tapé très fort.
Le site contient aussi des historiques de téléchargement, des diagrammes de dépendances et de reverse dependances. Il est participatif, et il y a moyen de s'inscrire pour améliorer les aides.
Et moyen d'exécuter les exemples sans lancer R, directement sur le site. Pas mal.
Vu la difficulté qu'il y a souvent à chercher dans les fonctions de R, je pense que le gars qui a fait ça a tapé très fort.
Intéressant: une communauté de gens qui partagent plein de trucs autour des couleurs, notamment des palettes.
Encore plus intéressant, le package colourlovers sous R permet d'importer facilement ces palettes sous R.
Encore plus intéressant, le package colourlovers sous R permet d'importer facilement ces palettes sous R.
YEEEEEEEES.
Très bonne analyse de la situation. Conclusion:
"So I think we—the statistics profession—should be offering guidelines on the design of exploratory studies."
Il me semble aussi.
ya déjà quelques éléments. J'ai survolé les commentaires, ya des discussions très intéressantes.
Décidément Andrew Gelman est un grand Monsieur...
Très bonne analyse de la situation. Conclusion:
"So I think we—the statistics profession—should be offering guidelines on the design of exploratory studies."
Il me semble aussi.
ya déjà quelques éléments. J'ai survolé les commentaires, ya des discussions très intéressantes.
Décidément Andrew Gelman est un grand Monsieur...
...avec une explication bien claire sur le fonctionnement de nice
Récupéré du Shaarli de sebsauvage. Je reproduis:
"Pour lancer une tâche en fond sans qu'elle me ralentisse, avec la priorité CPU et accès disque minimale, j'ai cet alias dans mon ~/.bashrc:
alias ni='nice -n 19 ionice -c3'
Pour lancer une commande, j'ajoute juste le 'ni' devant et ça roule...
Pratique pour compresser de gros dossiers en tâche de fond, par exemple."
"Pour lancer une tâche en fond sans qu'elle me ralentisse, avec la priorité CPU et accès disque minimale, j'ai cet alias dans mon ~/.bashrc:
alias ni='nice -n 19 ionice -c3'
Pour lancer une commande, j'ajoute juste le 'ni' devant et ça roule...
Pratique pour compresser de gros dossiers en tâche de fond, par exemple."
.
J'avions point vu. À tester.
(via Mathieu)
(via Mathieu)
Je vais essayer, j'ai besoin de déshumidifier certaines pièces chez moi.
Je connaissais pas. Mais je vais en avoir besoin!
J'aime bien ce genre de liens
L'article a l'air super intéressant, et les refs aussi (notamment une dans MEE sur l'analyse bayésienne des mouvements). En plus j'aime bien le deuxième auteur, il fait souvent des choses intéressantes.
À lire donc.
À lire donc.